Historia Muzeum Waginy sięga roku 2017, kiedy rozpoczęło działalność poprzez organizację wystaw pop-up. Dopiero w 2019 roku otworzyło się na stałe na terenie Camden Market, prezentując wystawę „Muff Busters: Mity o waginie i jak z nimi walczyć”. W ubiegłym roku, wraz z przeprowadzką do Bethnal Green, muzeum zorganizowało ekspozycje „Miesiączka: Krótka historia” oraz „Od A do V”, które przybliżały odwiedzającym m.inn. tematy anatomiczne.
Nagła konieczność opuszczenia obiektu w Bethnal Green w pierwszej połowie roku 2023 wynikała z faktu, że Muzeum Waginy działało na zasadach programu kurateli nieruchomości. Od otwarcia w 2019 roku, muzeum cieszyło się ogromnym zainteresowaniem, przyciągając ponad 175,000 odwiedzających. Jeżeli zbiórka zakończy się sukcesem, Muzeum Waginy nadal będzie zachęcać do otwartej rozmowy na temat waginy, edukując i inspirując zarówno kobiety, jak i mężczyzn.